熒光顯微鏡技術(shù)是目前在光鏡水平對特異蛋白質(zhì)等生物大分子定性定位研究的有力工具之一。熒光顯微鏡技術(shù)主要是用于檢測細(xì)胞上的特異熒光材料，與普通光學(xué)顯微鏡不同的是熒光顯微鏡增加了兩套濾光片。首套稱為激發(fā)光濾片，裝在光源和樣品之間，只有那些能激發(fā)熒光材料發(fā)光的特定波長的光才能通過。第二套稱為阻斷濾片，裝在物鏡和目鏡之間，只讓燃料所發(fā)出的熒光通過。在黑暗背景的襯托下，發(fā)出熒光的樣品很容易被觀察。

　　熒光顯微鏡技術(shù)包括免疫熒光技術(shù)和熒光素直接標(biāo)記技術(shù)。例如，將標(biāo)記熒光素的純化肌動蛋白顯微注射入培養(yǎng)細(xì)胞中，可以看到肌動蛋白分子組裝成肌動蛋白纖維。可將產(chǎn)生熒光的綠色熒光蛋白基因與某種蛋白質(zhì)基因融合，在表達(dá)這種融合蛋白的細(xì)胞中，便可直接在活體狀態(tài)下觀察到該蛋白在活細(xì)胞內(nèi)的動態(tài)變化。不同熒光素的激發(fā)波長范圍不同，所以同一樣品可以用兩種以上的熒光素標(biāo)記，同時顯示不同成分在細(xì)胞中的定位。

　　熒光顯微鏡用于研究細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)的吸收、運輸、化學(xué)物質(zhì)的分布及定位等。細(xì)胞中有些物質(zhì)，如葉綠素等，受紫外線照射后可發(fā)熒光;另有一些物質(zhì)本身雖不能發(fā)熒光，但如果用熒光染料或熒光抗體染色后，經(jīng)紫外線照射亦可發(fā)熒光，熒光顯微鏡就是對這類物質(zhì)進行定性和定量研究的工具之一。